QGISのGeoreferencer

ということで,QGISのGeoreferencerを使って幾何補正を行ってました。1.5G程度のファイルなのですが,補正結果がどーにもずれます。しかも,豪快に,5kmぐらいずれますw
色々悩んだのですが,元の画像を50%縮小して幾何補正したら,サクッとあってくれました。要するに,サイズがでかかったということでしょうか? ちと謎です・・・。